giovedì 3 aprile 2008

Compito 3-seconda parte-allineamento di sequenze di emoglobina di due organismi diversi

Entriamo nella pagina principale del sito dell'NCBI http://www.ncbi.nlm.nih.gov . Partiamo dall'interrogazione delle banche dati nucleotidiche . Nella pagina principale abbiamo cliccato su "core nucleotidiche" e selezionato nella finestra a tendina l'ambito in cui vogliamo effettuare la ricerca, in questo caso "nucleotide", per trovare la sequenza che codifica per la catena alfa uno dell'emoglobina. Nella query si immette "alpha hemoglobin", tra i risultati ottenuti clicchiamo su quella umana.Ora appare la pagina contenente le informazioni e le funzioni dell'emoglobina. In fondo alla pagina , sotto "Related Sequences" abbiamo cercato la sequenza nucleotidica corrispondete all'alfa emoglobina. Abbiamo cliccato su "sequence" e copiato e incollato sul blocco note la sequenza nucleotidica. Ripetiamo l'operazione cercando la sequenza dell'emoglobina di un altro organismo( noi quella di topo). Poi siamo andati sul sito http://www.ebi.ac.uk/align/, l'European Molecular Biology Laboratory ( EMBL), il corrispondente europeo dell'NCBI. Clicchiamo su tools poi su "sequence analysis" e poi su "align" per fare l'allineamento tra le due sequenze nucleotidiche precedentemente trovate e copiandole e incollandole nelle apposite finestre e selezionando l'opzione DNA

Parole:188
caterina corsini&chiara boscherini

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